Założona w 1937 r. fundacja Salomona Guggenheima prowadzi - samodzielnie lub we współpracy z instytucjami finansowymi (np. Deutsche Bank) lub innymi ośrodkami muzealnymi (np. Ermitaż) kilka muzów sztuki. Na ogromny zbiór składają się liczne kolekcje własne, zakupione lub otrzymane w darze, udostępnione publiczności w różnych miejscach świata.

Jako pierwsze otwarto w 1939 r. MUZEUM MALARSTWA ABSTRALCYJNEGO, obejmujące prace klasyków awangardy
Artyści: Rudolf Bauer, Hilla von Rebay, Wasilly Kandinsky, Piet Mondrian, Marc Chagall, Robert Delaunay, Fernand Léger, Amadeo Modigliani, Pablo Picasso

SOLOMON R. GUGGENHEIM FOUNDING COLLECTION

Podstawą zbioru było 600 dzieł przekazanych w latach 1937 – 1949, pochodzących z prywatnej kolekcji fundatora lub z zakupów dokonywanych w tych latach przez założoną przez niego fundację. Zbiór nosi nazwę Solomon R. Guggenheim Founding Collection i obejmuje m.in. dzieła Franza Marca, Marca Chagalla czy Vasilija Kandinskyego, Pierre Bonnarda, Roberta Delaynaya, Nauma Gabo, ALberta Gleizesa,  Juana Grisa, Laszlo Moholy-Nagy’a, Pieta Mondriana, Pabla Picasso, Henri Rousseau, Georgesa Seurata, Gino Severiniego

KARL NIERENDORF ESTATE
W 1948 r. muzeum zakupiło całość kolekcji nowojorskiego marszanda Karla Nierendorfa, poszerzając ofertę muzeum o prace niemieckich i austriackich ekspresjonistów oraz surrealistów (ponad 50 prac Paula Klee).
Artyści: Adolph Gottlieb, Juan Gris, Paul Klee, Oskar Kokoschka, Joan Miró

KATHERINE S. DREIER BEQUEST
W 1953 r. zapisem Katherine S. Dreier (z Duchampem i Man Rayem założyła Societe Anonyme) zbiór poszerzył się o 28 prace m.in. Brancusiego, Archiopenki, oraz kolaże Kurta Schwittersa.
Artyści: Alexander Calder, Marcel Duchamp, El Lissitzky, Kurt Schwitters

Szczególne miejsce zajmuje

KOLEKCJA PEGGY GUGGENHEIM W WENECJI

Wenecki Palazzo dei Leoni Venier przebudowany na muzeum

Siostrzenica Salomona Guggenheima, Peggy (1898-1979) była jednym z najważniejszych mecenasów sztuki współczesnej, łączącą znajomość tematu z żyłką do biznesu. Od końca lat 30-tych XX wieku Peggy Guggenheim zgromadziła wspaniałą kolekcję  sztuki współczesnej, dokonując szczególnie wielu zakupów w okresie przedwojennym i wojennym, a więc w czasach, gdy awangarda emigrowała z Europy do USA lub wegetowała w ciężkich warunkach w Europie. Zakupy Peggy Guggenheim umożliwiły wielu artystom przeżycie najtrudniejszego okresu.
Cała kolekcja zgromadzona w weneckim Palazzo dei Leoni Venier  przy Canal Grande została w 1969 r. włączona do zbiorów Guggenheima, ale pozostała w Wenecji i tam udostępniona jest publiczności.
Artyści: Karel Appel, Jean Arp, Edmondo Bacci, Francis Bacon, Giacomo Balla, Baziotes William, Umberto Boccioni, Constantin Brancusi, Georges Braque, Brauner Victor, Alexander Calder, Marc Chagall, Giorgio de Chirico, Joseph Cornell, Salvador Dalí, Willem de Kooning, Robert Delaunay, Paul Delvaux, Jean Dubuffet, Marcel Duchamp, Raymond Duchamp-Villon, Ernst Max, Alberto Giacometti, Albert Gleizesa, Julio González, Arshile Gorkiego, Juan Gris, David Hare, Jean Helion, Jorn Asger, Wasilij Kandinsky, Paul Klee, František Kupka, Henri Laurens, Fernand Léger, El Lissitzky, Heinz Mack, René Magritte, Kazimierz Malewicz, Marino Marini, Jean Metzinger, Joan Miró, Piet Mondrian, Henry Moore, Robert Motherwell, Ben Nicholson, Ozenfanta Amédée, Antoine Pevsner, Francis Picabia, Pablo Picasso, Jackson Pollock, Arnaldo Pomodoro, Man Ray Richier Germaine, Mark Rothko, Giuseppe Santomaso, Kurt Schwitters, Gino Severini, Clyfford Still, Rufino Tamayo, Tancredi Parmeggiani, Yves Tanguy, Mark Tobey, Theo van Doesburg Georges Vantongerloo, Emilio Vedova

SALOMON GUGGENHEIM MUSEUM NEW YORK

W związku z rozwojem kolekcji w 1943 r. Frank Lloyd Wright rozpoczął prace nad projektem nowego muzeum, które został oddane do użytku w 1959 r., po śmierci zarówno fundatora jak i architekta. Budowla ma charakter unikalny, jej istotę konstrukcyjną stanowi odwrócona spirala – nawiązanie – prawdopodobnie świadome - do spirali z Tatlinowskiego pomnika III Międzynarodówki. Projekt całkowicie ignoruje wszelkie wymogi wystawiennictwa, sam w sobie stanowi a-funkcjonalne dzieło sztuki i z tego względu wszedł do historii architektury.

Nowojorskie muzeum Guggenheima wg projektu Franka Lloyda Wrighta (1943-1959)

Nowojorskie muzeum ma tylko jedną salę wystawową - długie pomieszczenie zwinięte w rozszerzającą się ku górze spiralę.

KOLEKCJA TANNHAUSERA

W 1963 r. zbiory znacznie powiększyły się dzięki włączeniu kolekcji Justina K. Tannhausera obejmującej prace impresjonistów, postimpresjonistów i francuskich awangardystów. Znaczna ich część stanowiła wieczysty depozyt, a po śmierci darczyńcy, w 1978 r. stała się własnością muzeum. Kolekcja uzupełniana była przez wdowę po Tanhauserze w latach 1981-1991.
Artyści: Georges Braqu, Paul Cezanne, Edgar Degas, Edouard Manet, Paul Gauguin, Claude Monet, Pablo Picasso, Camille Pisarro, Pierre-Auguste Renoir, Vincent Van Gogh, Edouard Vuillard

THE PANZA COLLECTION

W latach 1991-1992 Muzeum zdobyło drogą zakupów lub darów ok. 350 prac minimalistów, post-minimalistów i konceptualistów za kolekcji księcia Giuseppe Panza di Biumo i jego żony Giovannay.
Artyści: Carl Andre, Dan Flavin, Donald Judd, Sol LeWitt, Robert Mangold, Brice Marden, Robert Morris, Bruce Nauman, Robert RYman, Richard Serra, James Turrell, Lawrence Weiner

THE HILLA REBAY COLLECTION

Hilla Rebay była pierwszym dyrektorem i kustoszem Muzeum Malarstwa Nieprzedstawiającego (przemianowanego na Muzeum Gugenheima) I właścicielką cennej kolekcji, która po jej śmierci została włączona do zbiorów Guggenheima.
Artyści: Paul Klee, Piet Mondrian

ROBERT MAPPLETHORPE GIFT FOUNDATION

W latach 1993-1998 do kolekcji Guggenheima włączono ok. 200 prac wybitnego fotografa Roberta Mapplethorpe’a

DEUTSCHE GUGGENHEIM

Siedziba Duetsche Guggenheim w Berlinie

Fragment instalacji z 2006 r. z Deutsche Guggenheim

Od 1997 r. działa oddział muzeum w Berlinie – Deutsche Guggenheim Berlin, mające siedzibę przy Unter den Linden i finansowane w znacznej mierze przez Deutsche Bank. Jest to niewielka galeria o powierzchni ok. 500 m2, prowadząca wystawy sztuki współczesnej we współpracy z kolekcją Deutsche Bank. Koncentruje się na promowaniu współczesnej produkcji artystycznej. Z tego względu w zbiorach i ekspozycjach przeważają artyści najmłodszych generacji i prace powstałe już na początku XXI wieku.
Artyści: John Baldessari, Hanne Darboven, Jeff Koons, Hiroshi Sugimoto, Jeff Wall, Rachel Whiteread

GUGGENHEIM BILBAO

Dekonstruktywistyczny budynek Guggenheim Bilbao projektu Franka Gehry

Szkic Gehry'ego do projektu muzeum w Bilbao - bardzo ładny...

Otwarte w 1997 r. muzum Guggenheima w hiszpańskim Bilbao koncentruje się na gromadzeniu sztuki współczesnej od połowy XX wieku. Muzeum znane jest z dekonstruktywistycznego projektu budynku autorstwa Franka Gehry, oraz rzeźby Louise Bourgeois, Maman, z 1999 r. Poza tym, jako muzeum stosunkowo młode, musi zadowalać się materiałem odpadowym, ponieważ lepsze prace klasyków drugiej awangardy zostały wcześniej podzielone między muzea o dłuższej tradycji.
Artyści: Joseph Beuys, Christian Boltanski, Louise Bourgeois, Eduardo Chillida, Francesco Clemente, Willem de Kooning, Gilbert & George, Jenny Holzer, Cristina Iglesias, Anselm Kiefer, Yves Klein, Jeff Koons, Richard Long, Robert Motherwell, Juan Muñoz, Jorge Oteiza, Jorge Oteiza, Sigmar Polke, Robert Rauschenberg, Gerhard Richter, James Rosenquist, Mark Rothko, Julian Schnabel, Richard Serra, Richard Serra, Susana Solano, Antoni Tàpies, Andy Warhol

THE BÖHEN FOUNDATION GIFT

275 prac 45 artystów zgromadzonych przez fundację Bohnen i włączonych do kolekcji w 2001 r., w tym prace fotograficzne, instalacje video, prezentuje stan sztuki współczesnej na przełomie wieków.
Artyści: Douglas Stan, Huyghe Pierre, Ligon Glenn, Iñigo Manglano-Ovalle, Sally Mann, Rika Noguchi, Rist Pipilotti, Rovner Michal, Hiroshi Sugimoto, Sam Taylor-Wood, Thater Diana, Bill Viola, Jane i Louise Wilson

......................

W 2000 r. otwarto wspólne przedsięwzięcie Guggenheima i Ermitażu  - Guggenheim Hermitage in Las Vegas, jednak, mimo deklarowanej dużej frekwencji został on zamknięty w 2008 r.

NOWE PROJEKTY

W Wilnie ma powstać według projektu Zahy Hadid muzeum będące wspólnym projektem Guggenheima i Ermitażu

Planowane jest także otwarcie muzeum w Adu Dhabi w budynku projektowanym również przez Franka Gehry.